Unang Whole-Genome–Based Traceability Analysis sa Brucella abortus sa Probinsya sa Zhejiang – Ang Bioinformatics Team gikan sa Macro & Micro-Test Nakatampo sa Hiniusang Publikasyon

—— Kolaboratibong Pagtuon sa Zhejiang CDC, Macro & Micro-Test, ug China CDC Gipatik sa Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

Kinatibuk-ang Pagtuon

Niadtong Mayo 2026, ang Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) nagpatik ug usa ka papel nga gipangulohan sa Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention (Zhejiang CDC), uban sa bioinformatics team gikan sa Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd. ug sa National Institute for Communicable Disease Control and Prevention (China CDC) isip mga co-author. Ang pagtuon giulohan ug:
“Pag-ila ug pag-analisar sa pilohenetiko sa pito ka matang sa Brucella abortus sa Zhejiang, China.”
Brucella abortus

Kini nga pagtuon nagrepresentar sa unang sistematiko, whole-genome–based phylogenetic traceability analysis sa Brucella abortus (B. abortus) sa Zhejiang Province, China. Gisusi sa team ang pito ka isolates nga nakolekta gikan sa 2015 hangtod 2025 (upat ka human-origin ug tulo ka bovine-origin strains gikan sa Jinhua, Quzhou, ug Ningbo). Ang mga nahibal-an naghatag og genomic nga ebidensya alang sa gigikanan ug mga ruta sa transmission niining "northern dominant species" sa usa ka atypical southern epidemic region sa silangang China.

 

Kaagi ug Kahulugan

 

Ang Brucellosis usa ka sakit nga zoonotic nga gipahinabo sa bakterya sa genus nga Brucella. Ang Brucella abortus kasagarang motakod sa mga baka apan mahimo usab nga hinungdan sa sakit sa mga tawo. Sa China, ang brucellosis nagpakita og dakong kalainan sa heyograpiya: ang pinakataas nga insidente mahitabo sa amihanang mga probinsya (pananglitan, Inner Mongolia, Shanxi, Heilongjiang). Sa kasukwahi, ang mga probinsya sa habagatan, lakip ang Zhejiang, kaniadto gidominar sa Brucella melitensis, nga adunay gamay ra kaayo nga gitaho nga mga kaso sa B. abortus. Kini nga kalainan sa rehiyon naghimo sa genetic characterization ug source tracing sa B. abortus sa Zhejiang nga usa ka hinungdanon nga prayoridad sa panglawas sa publiko.

 

Mga Pamaagi ug Pangunang mga Nakaplagan

Ang grupo sa mga tigdukiduki misagop ug usa ka estratehiya nga naghiusa sa molecular biology ug bioinformatics:

1.Pag-ila sa pathogen ug sukaranan nga pag-type

Ang BCSP-31 gene PCR ug AMOS-PCR nagpamatuod nga ang tanang pito ka isolates kay B. abortus.

Ang multilocus sequence typing (MLST) nga gibase sa siyam ka housekeeping genes nagbutyag nga ang tanang isolates nahisakop sa sequence type ST2, nga nagpakita sa taas nga genetic homogeneity taliwala sa naglibot nga B. abortus strains sa Zhejiang.
Pag-ila sa pathogen ug sukaranan nga pag-type

2.Pag-ila sa tibuok genome

Ang whole-genome sequencing gihimo sa Illumina NovaSeq platform. Ang average nucleotide identity (ANI) analysis nagpakita nga ang Zhejiang isolates adunay hangtod sa 99.99% nga pagkaparehas sa reference strain nga B. abortus 544.

Ang pan-genome analysis nagbutyag ug usa ka highly conserved population: 3,084 ka core genes ang nailhan, uban sa 10 lang ka shell genes, ug walay soft core o cloud genes ang nakita.

图片1

 

3.Mga profile sa gene sa virulence ug antimicrobial resistance

Usa ka kinatibuk-an nga 68 ka mga hinungdan nga may kalabutan sa virulence ang gitagna, nga naglangkob sa mga klasikal nga agianan sama sa LPS biosynthesis, ang T4SS secretion system, ug ang BvrR-BvrS two-component regulatory system. Talalupangdon nga ang tanan nga mga isolate walay mga adhesin gene nga bmaA ug btaF. Ang pag-analisa sa resistance gene nakamatikod lamang sa mprF gene sa CARD database, nga walay ubang mga determinant sa resistance nga nakit-an.

Pagkamapintas4. Pagtukod pag-usab sa pilohenetiko ug pagsubay sa transmisyon

Ang core-genome single-nucleotide polymorphism (cgSNP) analysis nagbutang sa mga Zhejiang isolates sa usa ka piho nga posisyon sa global phylogenetic tree. Ang mga resulta nagpakita nga ang mga Zhejiang strains nagporma og monophyletic group uban sa mga strains gikan sa Russia, Mongolia, ug pipila ka amihanang probinsya sa China (Ningxia, Heilongjiang, Inner Mongolia, Hebei, Gansu, Beijing). Kini nga grupo dugang nga nabahin ngadto sa tulo ka managlahing subclades (Clade 1–3), nga nagsugyot og daghang independente nga mga panghitabo sa pagpaila.

Pagtukod pag-usab sa pilohenetiko

Mga Konklusyon ug Implikasyon

 

Kini nga pagtuon naghatag sa unang taas nga katukma sa genomic dataset sa B. abortus sa Lalawigan sa Zhejiang ug naghatag ug pipila ka importanteng konklusyon:

 

  1. Clear henetikong kagikan– Ang mga strain sa B. abortus nga naglibot sa Zhejiang nahisakop sa ST2, taas og genomic conserved, ug nagrepresentar sa tipikal nga linya sa bovine brucellosis.

 

2. Evidepensa sa transmisyon sa tibuok rehiyon– Ang phylogenetic analysis wala mosuporta sa paglungtad sa usa ka independente nga endemic lineage sa Zhejiang. Hinuon, ang datos kusganong nagsugyot nga kini nga mga strain naggikan sa amihanang Tsina ug mahimong adunay parehas nga ebolusyonaryong background sa mga strain gikan sa Russia ug Mongolia. Ang presensya sa tulo ka subclades nagpasabot sa daghang managlahing introduction events.

 

3. Mga implikasyon sa panglawas sa publiko– Ang mga nakaplagan nagpasiugda sa bili sa genomic surveillance para sa brucellosis bisan sa mga rehiyon nga tradisyonal nga dili endemic sama sa Zhejiang. Bisan kung gamay ra ang kasamtangang ihap sa kaso, ang mga high resolution nga himan sama sa cgSNP epektibong makasubay sa tinubdan sa imported outbreaks ug makahatag og siyentipikong ebidensya aron maputol ang mga kadena sa transmission nga nalangkit sa interprovincial livestock transport.

 

Kini nga trabaho dili lang nagpuno sa kakulang sa panukiduki sa Lalawigan sa Zhejiang apan naghatag usab og bag-ong baseline data alang sa pagpaniid sa pathogen ug pagtimbang-timbang sa risgo sa brucellosis sa rehiyon sa Yangtze River Delta.

 

Impormasyon sa Papel:
Yang, Y., Shi, X., Chen, J., Wang, L., Wu, Z., Yao, W., … & Wu, B. (2026). Pag-ila ug phylogenetic analysis sa pito ka Brucella abortus strains sa Zhejiang, China. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 16, 1758965.

 

 


Oras sa pag-post: Hunyo-10-2026