Pag-ulbo sa Group C Rotavirus sa usa ka Primary School sa Luzhou, China, ug ang Whole-Genome Sequencing Technology sa Macro & Micro-Test Nagtugot sa Tukma nga Source Tracing

Bag-ohay lang,China CDC Weeklynagpatik ug usa ka importanteng artikulo sa panukiduki nga naghulagway sa epidemiological ug etiological nga imbestigasyon sa usa ka acute gastroenteritis outbreak nga gipahinabo sa Group C rotavirus (RVC) sa usa ka primary school sa Luzhou, Sichuan Province, niadtong Oktubre 2025. Ilabi na, ang high-throughput targeted pathogen capture kit (probe-capture) ug whole-genome enrichment sequencing technology sa Macro & Micro-Test adunay hinungdanong papel sa imbestigasyon. Pinaagi sa pagpahimo sa tukmang pag-ila sa pathogen ug komprehensibo nga genomic characterization, ang teknolohiya naghatag ug kritikal nga siyentipikong ebidensya alang sa paspas nga pagkumpirma sa outbreak, tukmang source tracing, ug epektibong pagkontrol sa outbreak.

Makro Mikro nga Pagsulay

Kalit nga Pag-ulbo: Unang Gireport nga Pag-ulbo sa RVC sa Habagatang-kasadpang Tsina

Niadtong Oktubre 15, 2025, usa ka acute gastroenteritis outbreak ang nahitabo sa usa ka primary school sa Luzhou. Ang eskwelahan adunay kinatibuk-ang populasyon nga 1,943 ka mga estudyante ug kawani, nga adunay 32 ka mga kaso nga gitaho, lakip ang 6 nga laboratory-confirmed ug 26 nga clinically diagnosed nga mga kaso, nga miresulta sa kinatibuk-ang attack rate nga 1.65%. Ang outbreak miabot sa kinapungkayan tali sa Oktubre 15 ug 16, diin ang Class 7, Grade 5 ang nakasinati sa pinakataas nga attack rate (23.08%). Kadaghanan sa mga pasyente mga bata nga nag-eskwela (median age: 10 ka tuig), nga nag-antos sa pagsuka (65.62%), kalibanga (46.87%), ug sakit sa tiyan (37.50%). Ang mga simtomas kasagaran molungtad og 1-3 ka adlaw, ug ang tanan nga mga pasyente naayo nga walay grabe nga mga komplikasyon.

Unang Gireport nga RVC

Ang imbestigasyon sa epidemiolohiya nag-ila sa index case isip usa ka 11 anyos nga batang lalaki sa Class 7, Grade 5. Ang iyang manghod nga babaye nakasinati na og susamang mga simtomas sa wala pa siya, nga nagsugyot nga ang pagkatap sa panimalay mao ang unang tinubdan. Ang dili igo nga pagdumala sa suka sa sulod sa kampus—lakip ang direktang pagsilhig ug paglabay nga walay tukma sa panahon nga pag-disinfect o pag-isolate sa lugar—inubanan sa dili maayo nga paglimpyo sa kamot sa mga estudyante, lagmit nakapadali sa dugang nga pagkatap. Kadaghanan sa mga naapektuhan nga mga klasrum nahimutang taliwala sa ikaduha ug ikalima nga andana ug gipaambit nga kasikbit nga mga kasilyas sa lalaki, nga nagpakita nga ang aerosol ug contact transmission mahimong nakatampo sa pagkaylap.

Ang imbestigasyon nahimong labi ka mahagiton tungod kay ang rutina nga screening sa pathogen, lakip ang mga pagsulay alang sa norovirus ug Group A rotavirus, naghatag negatibo nga mga resulta, nga nagpakita nga usa ka dili kasagaran nga pathogen ang responsable.

Diagnosis sa Etiolohiya: Ang Whole-Genome Sequencing sa Macro & Micro-Test Nag-ila sa Sad-an

Negatibo ang inisyal nga pagsulay para sa norovirus. Ang Luzhou CDC migamit dayon og multiplex gastrointestinal pathogen real-time PCR assay nga makahimo sa dungan nga pag-detect sa 28 ka pathogens, lakip ang 8 ka virus, 17 ka bacteria, ug 3 ka parasites, aron masusi ang walo ka clinical samples. Niadtong Oktubre 17, unom ka sample ang nagpositibo sa Group C rotavirus, nga malampusong nakaila sa causative pathogen.

Aron masubay pa ang tinubdan sa outbreak, gihimo sa mga imbestigador ang nanopore metagenomic sequencing ug ang Macro & Micro-Test's probe-capture whole-genome enrichment sequencing sa lima ka positibo nga sample. Kini nga pamaagi malampuson nga nakamugna og lima ka kompleto nga RVC genome sequences (SC01–SC05). Ang integrated strategy sa rapid multiplex PCR screening nga gisundan sa high-resolution whole-genome sequencing nakahatag og lig-on nga teknikal nga suporta para sa tukmang molecular epidemiology ug source tracing.

Mga Panabut sa Siyensya: Unang Pag-ila sa M2 Genotype sa Habagatang-kasadpang Tsina

Base sa taas nga kalidad nga datos sa tibuok genome nga nakuha gamit ang teknolohiya sa Macro & Micro-Test, ang grupo sa mga tigdukiduki nagtaho sa pipila ka importanteng siyentipikong mga nadiskobrehan:

Pagkumpirma sa usa ka monoclonal outbreak:Ang tanang lima ka viral isolates adunay parehas nga whole-genome genotype (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2), nga adunay 0–1 single nucleotide polymorphism (SNP) nga kalainan, nga nagpamatuod nga ang outbreak naggikan sa usa ka single transmission chain.

Pagdiskobre sa M2 genotype:Ang phylogenetic analysis nagbutyag nga ang Luzhou RVC strains nahisakop sa M2 genotype imbes sa M3 genotype nga kaniadto giisip nga dominante sa mga Chinese RVC strains. Kini nga nakaplagan naghagit sa naandan nga pagsabot sa RVC genotype distribution sa China ug nagpamatuod sa pagtungha sa M2 genotype sa habagatang-kasadpang China.

Ebidensya sa internasyonal nga mga sumpay sa transmission:Ang pagtandi sa whole-genome nagpakita sa taas nga genetic similarity tali sa Luzhou strains ug RVC strains nga gitaho kaniadto sa Yunnan (2025), Novosibirsk, Russia (2017), ug Italy (2012), nga nagsugyot sa paglungtad sa usa ka aktibo nga Eurasian transmission network.

 

Ebidensya sa internasyonal nga mga sumpay sa transmisyon

Mga Implikasyon alang sa Paglikay ug Pagkontrol: Ang Sayo nga Pag-ila ug Paspas nga Interbensyon Importante

Human sa pag-ila sa pathogen, ang Luzhou CDC diha-diha dayon nagpatuman sa komprehensibo nga mga lakang sa pagkontrol, lakip ang case isolation, environmental disinfection, standardized vomitus management, ug temporaryo nga class suspension. Malampusong nakontrol ang outbreak sulod sa usa ka incubation period, nga walay dugang nga mga kaso nga gitaho human sa Oktubre 21.

Ang imbestigasyon naghatag usab ug importanteng leksyon sa panglawas sa publiko: para sa mga clustered gastroenteritis outbreaks nga negatibo sa Group A rotavirus ug norovirus, ang Group C rotavirus ug uban pang non-Group A rotaviruses kinahanglan nga ilakip sa routine diagnostic screening.

Kini nga pagtuon nagrepresentar sa unang gitaho nga Group C rotavirus outbreak sa habagatang-kasadpang Tsina ug ang unang pag-ila sa M2 genotype sa rehiyon, nga nagpalapad sa kasamtangang pagsabot sa RVC epidemiology sa East Asia. Niini nga imbestigasyon, ang integrated solution sa Macro & Micro-Test nga naghiusa sa multiplex PCR screening uban sa whole-genome enrichment sequencing nagpakita og dakong praktikal nga bili pinaagi sa pagpahimo sa paspas nga pag-ila sa pathogen ug high-resolution molecular source tracing, nga naghatag og reproducible technical framework alang sa tukmang imbestigasyon ug pagkontrol sa umaabot nga mga outbreak sa makatakod nga sakit.

 


Oras sa pag-post: Hulyo-30-2026